17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2359 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2359    100 
 
 
903 bp  1790    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1561  transposase, IS605 OrfB family  83.59 
 
 
1203 bp  174  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.786289  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0724    98.82 
 
 
2092 bp  161  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00877806  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2464    98.82 
 
 
4069 bp  161  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2165    97.65 
 
 
5958 bp  153  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2166    97.65 
 
 
4516 bp  153  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2264    97.65 
 
 
1029 bp  153  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2520    98.73 
 
 
1222 bp  149  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2503    97.47 
 
 
1138 bp  141  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1577  transposase, IS605 OrfB family  82.38 
 
 
1191 bp  135  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.833624  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2390    96.25 
 
 
1348 bp  127  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0335  hypothetical protein  98.25 
 
 
132 bp  105  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.813334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2502  Transposase, ISC1217  96.55 
 
 
636 bp  99.6  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0805    89.33 
 
 
159 bp  85.7  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2380  transposase IS4 family protein  94.23 
 
 
870 bp  71.9  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1061  IS605 family transposase OrfB  96.88 
 
 
1230 bp  56  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00139779  hitchhiker  0.000000305099 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0964    93.75 
 
 
1138 bp  48.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000382138  normal  0.366665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>