12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2259 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0534    97.62 
 
 
1069 bp  1887    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1496    95.65 
 
 
2432 bp  979    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2045    93.62 
 
 
973 bp  1447    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0267006  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2259    100 
 
 
1069 bp  2119    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2381    98.98 
 
 
985 bp  1871    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2486  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.44 
 
 
1068 bp  1869    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0095339  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2503    97.52 
 
 
1138 bp  1152    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2590    97.03 
 
 
1949 bp  763    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2731  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  88.61 
 
 
1074 bp  170  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0404628  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2749  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  79.69 
 
 
1074 bp  168  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0806  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  81.12 
 
 
1068 bp  95.6  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.268698  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0744    89.47 
 
 
922 bp  65.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>