12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2045 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0534    93.57 
 
 
1069 bp  1433    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1496    95.91 
 
 
2432 bp  753    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2045    100 
 
 
973 bp  1929    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0267006  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2259    93.62 
 
 
1069 bp  1447    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2381    93.58 
 
 
985 bp  1435    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2486  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  93.91 
 
 
1068 bp  1465    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0095339  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2503    91.13 
 
 
1138 bp  712    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2590    90.62 
 
 
1949 bp  531  1e-148  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0806  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  81.63 
 
 
1068 bp  103  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.268698  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2731  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.84 
 
 
1074 bp  77.8  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0404628  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2749  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.88 
 
 
1074 bp  67.9  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0744    83.72 
 
 
922 bp  60  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>