21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2043 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1474  transposase IS4 family protein  100 
 
 
363 aa  734    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1497  transposase IS4 family protein  99.45 
 
 
363 aa  732    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2043  transposase IS4 family protein  100 
 
 
363 aa  734    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.547441  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2118  transposase IS4 family protein  97.14 
 
 
350 aa  657    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2208  transposase IS4 family protein  97.14 
 
 
350 aa  657    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2513  transposase IS4 family protein  98 
 
 
350 aa  692    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2591  transposase IS4 family protein  98.29 
 
 
375 aa  692    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0265  transposase IS4 family protein  97.43 
 
 
350 aa  660    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0001  transposase IS4  24.26 
 
 
379 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.127623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0047  transposase  22.92 
 
 
228 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000399191  normal  0.0497457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0717  hypothetical protein  25.22 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137739  normal  0.0455939 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0718  transposase, IS4 family protein  27.35 
 
 
415 aa  50.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0553723  normal  0.0430259 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2857  transposase IS4 family protein  22.36 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0054  transposase IS4 family protein  22.36 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00175854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1024  transposase IS4 family protein  22.36 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.765298  normal  0.715821 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1606  transposase IS4 family protein  22.36 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.207123 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1840  transposase IS4 family protein  22.36 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156024  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3439  transposase IS4 family protein  22.36 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1988  transposase  19.79 
 
 
216 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.676841  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3567  transposase IS4 family protein  32.39 
 
 
687 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3516  transposase IS4 family protein  23.11 
 
 
390 aa  43.5  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>