22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1960 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0375  Transposase, ISC1217  98.31 
 
 
354 aa  707    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0135211  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2880  Transposase, ISC1217  96.89 
 
 
354 aa  698    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2794  Transposase, ISC1217  98.31 
 
 
354 aa  707    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2652  Transposase, ISC1217  98.31 
 
 
354 aa  707    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2631  Transposase, ISC1217  96.05 
 
 
354 aa  691    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.728346  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2605  Transposase, ISC1217  100 
 
 
354 aa  717    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2534  Transposase, ISC1217  96.61 
 
 
354 aa  697    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.664602  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2435  Transposase, ISC1217  96.61 
 
 
354 aa  696    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.27538  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2355  Transposase, ISC1217  98.02 
 
 
354 aa  703    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2159  Transposase, ISC1217  98.02 
 
 
354 aa  703    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1960  Transposase, ISC1217  100 
 
 
354 aa  717    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1359  Transposase, ISC1217  96.89 
 
 
354 aa  698    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0537  Transposase, ISC1217  96.89 
 
 
354 aa  698    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0366  Transposase, ISC1217  98.02 
 
 
354 aa  703    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.672402  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2502  Transposase, ISC1217  96.43 
 
 
211 aa  388  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0721  Transposase, ISC1217  96.88 
 
 
136 aa  258  9e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.864923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1568  transposase, IS4 family protein  27.04 
 
 
457 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2861  transposase, IS4 family protein  27.04 
 
 
457 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0836  transposase, IS4 family protein  26.75 
 
 
460 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1545  transposase, IS4 family protein  26.75 
 
 
460 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2804  transposase, IS4 family protein  26.75 
 
 
460 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0130073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1850  transposase, IS4 family protein  26.75 
 
 
378 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>