17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1447 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2273  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1095 bp  1080    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2655    100 
 
 
2330 bp  846    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.000297792  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2643    98.72 
 
 
1285 bp  1025    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2632  transposase IS4 family protein  99.27 
 
 
1095 bp  1049    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.17948  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2347  transposase IS4 family protein  99.82 
 
 
1095 bp  1072    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0455002  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2325    100 
 
 
2327 bp  686    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0486807  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0283    99.63 
 
 
2747 bp  1065    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1447    100 
 
 
564 bp  1118    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0342292  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1351  transposase IS4 family protein  99.27 
 
 
1095 bp  1049    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0683    99.71 
 
 
2327 bp  678    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.000431715  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0284  transposase IS4 family protein  99.63 
 
 
1095 bp  1065    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2194    99 
 
 
756 bp  381  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0533    87.14 
 
 
2426 bp  299  4e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2481    96.97 
 
 
102 bp  115  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0738    86.59 
 
 
974 bp  75.8  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000736258  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2417    96.67 
 
 
779 bp  52  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.008461  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2378    83.12 
 
 
978 bp  50.1  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>