12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0534 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0534    100 
 
 
1069 bp  2119    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1496    95.12 
 
 
2432 bp  981    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2045    93.57 
 
 
973 bp  1433    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0267006  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2259    97.62 
 
 
1069 bp  1887    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2381    97.97 
 
 
985 bp  1792    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2486  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.72 
 
 
1068 bp  1887    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0095339  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2503    97.94 
 
 
1138 bp  1146    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2590    98.63 
 
 
1949 bp  819    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2731  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  87.26 
 
 
1074 bp  153  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0404628  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2749  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.18 
 
 
1074 bp  115  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0806  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.93 
 
 
1068 bp  91.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.268698  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0744    91.23 
 
 
922 bp  73.8  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>