152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4440 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_4440  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
189 aa  387  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439449  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4832  phospholipid/glycerol acyltransferase  81.72 
 
 
214 aa  318  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4156  phospholipid/glycerol acyltransferase  72.68 
 
 
183 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3750  phospholipid/glycerol acyltransferase  69.23 
 
 
183 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144073 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3630  acyltransferase family protein  65.57 
 
 
183 aa  262  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0119  phospholipid/glycerol acyltransferase  63.93 
 
 
186 aa  261  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038904 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0114  phospholipid/glycerol acyltransferase  63.93 
 
 
186 aa  259  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0119  phospholipid/glycerol acyltransferase  63.39 
 
 
186 aa  258  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0963438 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4235  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.09 
 
 
187 aa  257  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0119  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.09 
 
 
187 aa  257  9e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0123  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.09 
 
 
187 aa  257  9e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0124  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.09 
 
 
187 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0123  acyltransferase family protein  61.75 
 
 
186 aa  255  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0088  phospholipid/glycerol acyltransferase  62.09 
 
 
184 aa  252  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0120  phospholipid/glycerol acyltransferase  63.54 
 
 
187 aa  251  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.179228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3949  phospholipid/glycerol acyltransferase  59.34 
 
 
184 aa  238  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2191  hypothetical protein  50.83 
 
 
187 aa  203  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2219  hypothetical protein  50.83 
 
 
187 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3447  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.12 
 
 
188 aa  148  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2802  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.71 
 
 
183 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04680  hypothetical protein  39.29 
 
 
192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0451  hypothetical protein  39.29 
 
 
192 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4196  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.36 
 
 
192 aa  130  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02764  acyltransferase  38.51 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2166  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.16 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01012  Acyltransferase family protein  34.29 
 
 
211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.501742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1712  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.16 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10462  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0561  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.46 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4020  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.53 
 
 
210 aa  122  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0488  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.21 
 
 
188 aa  121  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2670  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.5 
 
 
204 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0440614 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0148  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.79 
 
 
209 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0168  hypothetical protein  37.87 
 
 
209 aa  117  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2518  pseudouridine synthase, RluD  35.23 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1355  acyltransferase, putative  36.69 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1783  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.91 
 
 
173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175926  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2093  hypothetical protein  35.71 
 
 
244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.821432  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0180  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.99 
 
 
200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37610  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.06 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2254  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.09 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1051  hypothetical protein  37.5 
 
 
191 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.961359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2245  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.94 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0239387  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0958  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.99 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2413  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.5 
 
 
244 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1033  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.22 
 
 
210 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4324  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.25 
 
 
200 aa  104  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.270681 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0677  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.77 
 
 
185 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2517  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.66 
 
 
201 aa  98.2  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.38065  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0997  acyltransferase family protein  33.71 
 
 
290 aa  97.8  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22670  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.05 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0134  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.26 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3457  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.91 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0632621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3737  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.93 
 
 
193 aa  88.6  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0472119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0195  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.3 
 
 
172 aa  84  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1325  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.37 
 
 
203 aa  79  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0644  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.21 
 
 
235 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.54251e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1470  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.55 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3386  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30 
 
 
196 aa  54.7  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000418539  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002416  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.79 
 
 
241 aa  52  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03651  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.33 
 
 
241 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1330  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  27.41 
 
 
193 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000270973  normal  0.0367266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2065  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.34 
 
 
239 aa  48.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000189855  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2439  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.07 
 
 
259 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3227  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.63 
 
 
252 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123121  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3040  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.68 
 
 
236 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13850  acyltransferase  30 
 
 
259 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.523346 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2024  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.66 
 
 
239 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2352  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.66 
 
 
239 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000249527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3400  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.32 
 
 
254 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2967  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.99 
 
 
240 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3426  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.65 
 
 
245 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2095  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.43 
 
 
261 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1453  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.63 
 
 
239 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2267  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.97 
 
 
239 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1632600000000004e-34 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2270  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.97 
 
 
239 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000119102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2086  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.97 
 
 
239 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000321882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2026  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.97 
 
 
239 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.718399999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3101  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.66 
 
 
239 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000192666  hitchhiker  6.55431e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2240  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.97 
 
 
239 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101928  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3044  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.84 
 
 
238 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000160916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0508  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.14 
 
 
257 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.216043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3423  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.06 
 
 
245 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0682  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.07 
 
 
245 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3524  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.06 
 
 
245 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.850117  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3354  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.06 
 
 
245 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3359  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.49 
 
 
245 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.33139 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0340  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.63 
 
 
245 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3429  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.06 
 
 
245 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3196  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.07 
 
 
245 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0679  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.07 
 
 
245 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.554876 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0780  acyltransferase family protein  28.97 
 
 
246 aa  45.4  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.220724  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1036  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.82 
 
 
272 aa  45.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3544  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.93 
 
 
240 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0192  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.59 
 
 
201 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2223  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.97 
 
 
239 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000296239  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02890  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.49 
 
 
245 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77657  predicted protein  32.56 
 
 
298 aa  44.3  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0482722  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4329  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.49 
 
 
245 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1153  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.71 
 
 
262 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490723  normal  0.0562479 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0512  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.7 
 
 
241 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.505024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>