23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4380 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4380  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 332 aa  689    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.113804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2805  aminoglycoside phosphotransferase  41.09 
 
 		 345 aa  252  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.34105  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2943  aminoglycoside phosphotransferase  33.82 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0715  hypothetical protein  27.34 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2754  aminoglycoside phosphotransferase  23.65 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2164  aminoglycoside phosphotransferase  24.64 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0130  aminoglycoside phosphotransferase  29.09 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.670297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1044  phosphotransferase enzyme family, putative  23.35 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.9915e-20 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  25.65 
 
 		 287 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2229  Fructosamine/Ketosamine-3-kinase  25.74 
 
 		 290 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0332  serine/threonine protein kinase  24.12 
 
 		 345 aa  46.2  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1851  aminoglycoside phosphotransferase  25.37 
 
 		 267 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1585  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase  23.94 
 
 		 479 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.616804  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2761  aminoglycoside phosphotransferase  23.94 
 
 		 479 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2806  aminoglycoside phosphotransferase  23.94 
 
 		 479 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0356715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2263  hypothetical protein  20.75 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0394341  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5102  hypothetical protein  37.35 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3657  serine/threonine protein kinase  24.39 
 
 		 345 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2852  aminoglycoside phosphotransferase  23 
 
 		 312 aa  43.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00333465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2233  hypothetical protein  20.75 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2079  hypothetical protein  20.75 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3066  hypothetical protein  23.19 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2017  hypothetical protein  22.8 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000163983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>