54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4219 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4219  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  256  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0381  hypothetical protein  80.92 
 
 		 133 aa  209  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0278  hypothetical protein  63.64 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3982  hypothetical protein  59.4 
 
 		 136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3683  hypothetical protein  60.15 
 
 		 136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4091  hypothetical protein  59.4 
 
 		 136 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4178  hypothetical protein  59.4 
 
 		 136 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4060  hypothetical protein  58.65 
 
 		 136 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0232  hypothetical protein  67.18 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.558206  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3440  hypothetical protein  59.38 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140437  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3875  hypothetical protein  56.06 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0588899 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0309  hypothetical protein  55.3 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0274  hypothetical protein  55.3 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3671  hypothetical protein  55.3 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0395  hypothetical protein  51.16 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3350  hypothetical protein  48.87 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3680  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  39.47 
 
 		 133 aa  90.1  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000277  glutathione S-transferase-related protein  35.43 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.829142  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0640  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  38.14 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.136353 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2150  hypothetical protein  39.56 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.195543  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2428  hypothetical protein  39.56 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940276  normal  0.0458059 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0339  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  35.04 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2037  hypothetical protein  39.56 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2096  hypothetical protein  40.66 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2100  putative inner membrane protein  38.46 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1317  putative inner membrane protein  38.46 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2605  putative inner membrane protein  38.46 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.906436  normal  0.129017 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01828  hypothetical protein  38.46 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1771  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000931385  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1963  putative inner membrane protein  38.46 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01840  predicted inner membrane protein  38.46 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2058  hypothetical protein  37.36 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85974 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1343  putative inner membrane protein  37.36 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.46281  hitchhiker  0.000563123 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1219  putative inner membrane protein  37.36 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2118  hypothetical protein  37.36 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2063  hypothetical protein  37.36 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2437  putative inner membrane protein  36.67 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1812  hypothetical protein  40.66 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1763  hypothetical protein  38.46 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01106  uncharacterized relative of glutathione S-transferase  34.71 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.285052  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2045  glutathione S-transfersae-related protein  32.03 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2167  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2264  hypothetical protein  31.25 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2892  uncharacterized relative of glutathione S-transferase  32.56 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0632  hypothetical protein  36.64 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0704  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  35.35 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2785  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639584  normal  0.118988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4532  hypothetical protein  35.23 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0111  hypothetical protein  31.62 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1421  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  35.19 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573394  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3553  hypothetical protein  35.19 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.575226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2369  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  31.33 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0204  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  35.71 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4399  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  31.87 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>