61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4164 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4164  acetolactate synthase small subunit  100 
 
 		 86 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0443  amino acid-binding ACT domain-containing protein  73.97 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.886591 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0290  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  65.82 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3613  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  66.22 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0363  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  60.71 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4030  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  66.22 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4008  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  66.22 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0357  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  60.71 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3663  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  60.71 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3933  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  66.22 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4127  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  66.22 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4346  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  60.71 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0346  amino acid-binding ACT domain-containing protein  63.16 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.550945  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0423  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  55 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3413  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  58.33 
 
 		 93 aa  87  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0139  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  46.34 
 
 		 85 aa  73.6  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4031  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.612763  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4220  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4060  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.75 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0483  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.75 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.242348 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0155  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.75 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3775  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  43.9 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4759  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  49.28 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4184  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  56.14 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4233  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  56.14 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.594626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4112  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  56.14 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4127  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  56.14 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4292  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  56.14 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4014  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  54.39 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4151  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.75 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4135  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.75 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.683239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4233  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.75 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.196128  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5203  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.75 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03596  hypothetical protein  50.75 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0138992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4207  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.75 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4280  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.75 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3986  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.75 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03647  acetolactate synthase II, small subunit  50.75 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0148  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  53.62 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0054  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  42.11 
 
 		 82 aa  63.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002040  acetolactate synthase small subunit  42.67 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00411  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  44.78 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4844  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  43.28 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2489  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  47.76 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0347  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.97 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3280  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  60.81 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2115  hypothetical protein  40.91 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  36.25 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1708  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  33.77 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.890134  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  34.18 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  35.06 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  31.25 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1667  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  32.47 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1852  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  32.47 
 
 		 76 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3490  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  32.47 
 
 		 76 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1241  acetolactate synthase, small subunit  33.77 
 
 		 179 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1935  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  32.47 
 
 		 76 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2145  acetolactate synthase, small subunit  34.21 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.168594  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  33.78 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  29.89 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.25 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>