21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4086 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4086  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  247  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0536  hypothetical protein  77.69 
 
 		 123 aa  199  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0213878  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0551  hypothetical protein  76.86 
 
 		 121 aa  192  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0513  hypothetical protein  74.58 
 
 		 121 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3518  hypothetical protein  74.58 
 
 		 121 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0513  hypothetical protein  74.58 
 
 		 121 aa  189  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.819192  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0514  hypothetical protein  73.73 
 
 		 135 aa  187  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3361  hypothetical protein  73.33 
 
 		 127 aa  184  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3796  hypothetical protein  73.28 
 
 		 121 aa  183  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3852  hypothetical protein  73.28 
 
 		 121 aa  183  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3346  hypothetical protein  73.28 
 
 		 121 aa  183  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0472  hypothetical protein  73.28 
 
 		 121 aa  183  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.088779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3978  hypothetical protein  72.41 
 
 		 121 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3283  hypothetical protein  72.03 
 
 		 121 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3192  hypothetical protein  68.7 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3591  hypothetical protein  70.34 
 
 		 121 aa  174  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 		 285 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  24.79 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  25.21 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  25.69 
 
 		 120 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  23.68 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>