41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1824 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1824  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2278  hypothetical protein  67 
 
 		 103 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445421  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2524  hypothetical protein  63.11 
 
 		 105 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2517  hypothetical protein  63.11 
 
 		 105 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.955293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2637  hypothetical protein  62.14 
 
 		 105 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1494  hypothetical protein  64 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1827  hypothetical protein  60.19 
 
 		 105 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.437547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1625  hypothetical protein  63.37 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1701  hypothetical protein  61.39 
 
 		 110 aa  127  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1700  hypothetical protein  60.4 
 
 		 103 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2692  hypothetical protein  55.34 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1763  hypothetical protein  59.18 
 
 		 105 aa  122  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0816952  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1922  hypothetical protein  56 
 
 		 104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1560  hypothetical protein  55.88 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3207  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3219  hypothetical protein  51 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3285  hypothetical protein  49.04 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3387  hypothetical protein  49.04 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.391337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3282  hypothetical protein  51 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1651  hypothetical protein  52.48 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.865304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2802  hypothetical protein  51.02 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3033  hypothetical protein  50.5 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05196  hypothetical protein  50.94 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4192  hypothetical protein  49 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0792  protein of unknown function DUF437  49 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0809  hypothetical protein  49 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0595  hypothetical protein  49.51 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3436  hypothetical protein  48.51 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.345221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1180  hypothetical protein  47.57 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.445201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3227  hypothetical protein  49 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3059  hypothetical protein  49 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02732  hypothetical protein  49 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.685634  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02695  hypothetical protein  49 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.685116  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001315  hypothetical protein  49.06 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3321  hypothetical protein  48 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3318  hypothetical protein  48 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0075  hypothetical protein  46.08 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2444  hypothetical protein  44.9 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1631  hypothetical protein  44.9 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2348  hypothetical protein  44.9 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.668511  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1652  hypothetical protein  44.12 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>