18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1200 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1200  type IV pilus assembly protein PilX  100 
 
 		 144 aa  285  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00971414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2951  type IV pilus assembly protein PilX  67.33 
 
 		 150 aa  208  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.114107  normal  0.117946 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1105  type IV pilus assembly protein PilX  76.39 
 
 		 144 aa  207  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.711381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1065  type IV pilus assembly protein PilX  70.14 
 
 		 144 aa  207  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1060  type IV pilus assembly protein PilX  60.78 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3229  hypothetical protein  60.78 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1127  type IV pilus assembly protein PilX  60.78 
 
 		 153 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1162  type IV pilus assembly protein PilX  60.13 
 
 		 153 aa  190  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3526  hypothetical protein  58.82 
 
 		 153 aa  183  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3130  type IV pilus assembly protein PilX  59.21 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.706597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3033  type IV pilus assembly protein PilX  55.84 
 
 		 156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1297  type IV pilus assembly protein PilX  60.69 
 
 		 142 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0930  type IV pilus assembly protein PilX  52.6 
 
 		 156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.881011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1089  type IV pilus assembly protein PilX  50.68 
 
 		 145 aa  154  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2884  type IV pilus assembly protein PilX  52.74 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2717  type IV pilus assembly protein PilX  48.94 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1215  hypothetical protein  28.75 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2559  Tfp pilus assembly protein PilX-like  38.18 
 
 		 213 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0751732  normal  0.24266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>