14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9245 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9245  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7349  hypothetical protein  39.02 
 
 
259 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3998  hypothetical protein  41.46 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4495  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9020  hypothetical protein  35.48 
 
 
124 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4770  hypothetical protein  32.52 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.444502  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0721  hypothetical protein  39.84 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0171189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2121  hypothetical protein  34.88 
 
 
196 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277797  normal  0.0126504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2265  hypothetical protein  39.84 
 
 
136 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210713  normal  0.0751956 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0648  Protein of unknown function DUF2267  36.97 
 
 
136 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270306  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3361  hypothetical protein  36.67 
 
 
121 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
286 aa  55.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3823  Protein of unknown function DUF2267  30.08 
 
 
131 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2270  hypothetical protein  35.88 
 
 
133 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000078437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>