16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9190 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9190  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  268  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8102  hypothetical protein  52.46 
 
 
134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0481  hypothetical protein  39 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571872  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9099  hypothetical protein  40.26 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8485  hypothetical protein  31.25 
 
 
137 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8527  hypothetical protein  31 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0143221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0443  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4831  hypothetical protein  29.35 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21050  hypothetical protein  37.33 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0401798  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0741  hypothetical protein  38.1 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000127802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8099  hypothetical protein  29.89 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05930  hypothetical protein  31.3 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8082  hypothetical protein  30.67 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780581  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5552  hypothetical protein  28.89 
 
 
120 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6386  hypothetical protein  29.36 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.320315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3451  hypothetical protein  29.75 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>