42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8905 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  54.75 
 
 		 790 aa  719    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  100 
 
 		 789 aa  1530    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  58.34 
 
 		 857 aa  839    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  44.75 
 
 		 789 aa  501  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  39.78 
 
 		 837 aa  456  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  40.23 
 
 		 751 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  38.57 
 
 		 876 aa  435  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  40.23 
 
 		 752 aa  423  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  41.49 
 
 		 761 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  41.14 
 
 		 747 aa  419  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  36.96 
 
 		 820 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  40.03 
 
 		 758 aa  372  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  39.92 
 
 		 820 aa  350  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  34.99 
 
 		 758 aa  334  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  35.71 
 
 		 764 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  34.97 
 
 		 751 aa  310  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  34.64 
 
 		 777 aa  310  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  35.09 
 
 		 764 aa  308  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  35.73 
 
 		 739 aa  307  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  34.09 
 
 		 748 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  33.33 
 
 		 759 aa  301  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  33.75 
 
 		 756 aa  295  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  32.86 
 
 		 834 aa  293  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  33.66 
 
 		 826 aa  291  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  35.91 
 
 		 762 aa  279  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  33.89 
 
 		 726 aa  278  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  39.51 
 
 		 817 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  40.62 
 
 		 953 aa  253  9.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  33.05 
 
 		 779 aa  226  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  42.71 
 
 		 745 aa  224  7e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  31.98 
 
 		 719 aa  206  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  31.12 
 
 		 822 aa  197  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  28.8 
 
 		 840 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  30.42 
 
 		 798 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  28.75 
 
 		 856 aa  163  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0638496 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.59 
 
 		 548 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  33.33 
 
 		 550 aa  51.2  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1917  hypothetical protein  22.3 
 
 		 557 aa  49.3  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00808951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 550 aa  47.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  30.73 
 
 		 548 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  27.67 
 
 		 561 aa  46.2  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  28.83 
 
 		 551 aa  45.8  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>