14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8102 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8102  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  273  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9190  hypothetical protein  52.46 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0481  hypothetical protein  43.01 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571872  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4831  hypothetical protein  37.5 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9099  hypothetical protein  35.87 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8527  hypothetical protein  31.03 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0143221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8485  hypothetical protein  25 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0443  hypothetical protein  33.72 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8099  hypothetical protein  28.45 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6455  hypothetical protein  36.78 
 
 
174 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3451  hypothetical protein  32.29 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6386  hypothetical protein  26.83 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.320315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21050  hypothetical protein  31.52 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0401798  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0934  hypothetical protein  27.37 
 
 
163 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>