17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8082 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8082  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780581  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8085  hypothetical protein  41.3 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7887  hypothetical protein  42.34 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0788  hypothetical protein  31.07 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0741  hypothetical protein  31.13 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000127802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0535  hypothetical protein  31.19 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000537428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4909  hypothetical protein  27.06 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8099  hypothetical protein  23.08 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0045  hypothetical protein  39.39 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9190  hypothetical protein  30.67 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0483  hypothetical protein  31.62 
 
 
137 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0481  hypothetical protein  31.51 
 
 
145 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571872  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21050  hypothetical protein  28.79 
 
 
171 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0401798  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  31.03 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5552  hypothetical protein  31.08 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  26.14 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  30.59 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>