17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7349 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7349  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  507  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9245  hypothetical protein  38.02 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1455  hypothetical protein  37.3 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0296741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0721  hypothetical protein  39.84 
 
 
127 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0171189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2121  hypothetical protein  35.16 
 
 
196 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277797  normal  0.0126504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3998  hypothetical protein  34.38 
 
 
137 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4495  hypothetical protein  33.06 
 
 
133 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3361  hypothetical protein  36.13 
 
 
121 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9020  hypothetical protein  31.71 
 
 
124 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2265  hypothetical protein  36.84 
 
 
136 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210713  normal  0.0751956 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4770  hypothetical protein  30.89 
 
 
125 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.444502  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2270  hypothetical protein  35.88 
 
 
133 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000078437  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0648  Protein of unknown function DUF2267  32.77 
 
 
136 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  27.81 
 
 
286 aa  48.9  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3703  Protein of unknown function DUF2267  31.75 
 
 
138 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3772  Protein of unknown function DUF2267  31.25 
 
 
172 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07750  hypothetical protein  32.81 
 
 
136 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>