13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6980 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6980    100 
 
 		 144 bp  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270706 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2598    89.47 
 
 		 1184 bp  87.7  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383932  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2502    83.19 
 
 		 1273 bp  77.8  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4941    88.57 
 
 		 114 bp  75.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.941947  normal  0.184259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2753  transposase  82.4 
 
 		 897 bp  73.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1609  transposase IS4 family protein  86.67 
 
 		 1239 bp  69.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.200563  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2535  transposase IS4 family protein  86.67 
 
 		 1239 bp  69.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011121  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2537  transposase IS4 family protein  86.67 
 
 		 1239 bp  69.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000138999  hitchhiker  0.00019554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2794  transposase IS4 family protein  87.3 
 
 		 1257 bp  61.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4393    94.59 
 
 		 1240 bp  58  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3175  transposase, IS4  87.5 
 
 		 141 bp  56  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4190    84.62 
 
 		 435 bp  50.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3970  transposase IS4 family protein  93.33 
 
 		 1605 bp  44.1  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>