23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5498 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5498  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  263  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00390859  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2742  ChaB family protein  76.92 
 
 		 131 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.764397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14450  hypothetical protein  72.52 
 
 		 136 aa  187  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0893  hypothetical protein  69.92 
 
 		 134 aa  184  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  67.41 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3652  ChaB  65.62 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3725  ChaB family protein  65.62 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1756  hypothetical protein  65.65 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721453  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3665  ChaB family protein  64.84 
 
 		 139 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2019  ChaB family protein  62.04 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742631  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0793  ChaB family protein  63.28 
 
 		 139 aa  164  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1742  hypothetical protein  63.36 
 
 		 137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198279  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1804  hypothetical protein  65.83 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3007  ChaB family protein  65.08 
 
 		 141 aa  155  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000471912  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3411  hypothetical protein  60.63 
 
 		 141 aa  153  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0871  ChaB family protein  60.61 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02480  ChaB protein  60.32 
 
 		 141 aa  150  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1538  hypothetical protein  63.85 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.213562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4490  ChaB family protein  57.48 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0646  hypothetical protein  58.54 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01038  hypothetical protein  53.33 
 
 		 87 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0473132  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13248  hypothetical protein  35.29 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23330  hypothetical protein  60 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>