11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3611 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3611    100 
 
 		 888 bp  1760    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4729    80.92 
 
 		 522 bp  81.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4009  transposase, IS4  92.86 
 
 		 771 bp  60  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5006    85.71 
 
 		 481 bp  60  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.181557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  83.53 
 
 		 438 bp  58  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19870    84.42 
 
 		 447 bp  58  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.368618  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3067    85.96 
 
 		 219 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213345  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2910    88.89 
 
 		 869 bp  50.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216552  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  96.43 
 
 		 1497 bp  48.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13890  transposase family protein  83.82 
 
 		 312 bp  48.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.417706  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20960  putative Transposase, IS4 family  90 
 
 		 384 bp  48.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.592234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>