14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3400 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3400  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  339  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2985  hypothetical protein  48.4 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000610885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3434  major facilitator transporter  45.9 
 
 		 201 aa  90.9  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0145868  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3484  hypothetical protein  42.34 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3081  hypothetical protein  35.91 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1775  hypothetical protein  31.61 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.741384  normal  0.308544 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4176  hypothetical protein  37.6 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2053  hypothetical protein  34.64 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00648458  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30990  hypothetical protein  31.19 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.115562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3069  hypothetical protein  31.44 
 
 		 237 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0580303  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3580  hypothetical protein  38.02 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4789  hypothetical protein  32.83 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  38.36 
 
 		 424 aa  42.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7243  hypothetical protein  31.94 
 
 		 237 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0332124  normal  0.269504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>