12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3237 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3237  radical SAM domain protein  100 
 
 		 298 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533932  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0740  hypothetical protein  69.96 
 
 		 302 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4105  hypothetical protein  67.49 
 
 		 310 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.922484  normal  0.477989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1174  Radical SAM domain protein  66.67 
 
 		 312 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1840  radical SAM domain-containing protein  51.07 
 
 		 288 aa  285  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1643  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 		 283 aa  158  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4242  putative inner membrane protein  34.87 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4399  putative inner membrane protein  35.25 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4221  hypothetical protein  34.87 
 
 		 292 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3662  radical SAM domain-containing protein  38.6 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0740  Fe-S oxidoreductase-like  26.75 
 
 		 379 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1722  radical SAM domain-containing protein  21.61 
 
 		 350 aa  42.7  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0575415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>