17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1384 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1384  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  906    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0753  hypothetical protein  53.89 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0387662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4066  hypothetical protein  39.78 
 
 		 601 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2513  hypothetical protein  35.16 
 
 		 471 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0461  hypothetical protein  30.12 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.274744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7607  hypothetical protein  27.7 
 
 		 582 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3763  hypothetical protein  28.84 
 
 		 582 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1265  hypothetical protein  29.56 
 
 		 558 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000106204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1413  hypothetical protein  26.41 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0668579  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1194  hypothetical protein  26.07 
 
 		 577 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1208  hypothetical protein  26.94 
 
 		 528 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2345  hypothetical protein  32.88 
 
 		 507 aa  70.1  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.274272  hitchhiker  0.00000585461 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20770  hypothetical protein  26.76 
 
 		 560 aa  67  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0250367  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2547  hypothetical protein  33.33 
 
 		 538 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5862  hypothetical protein  33.33 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000662704  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0747  glycosyltransferases-like  30.59 
 
 		 1713 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09080  hypothetical protein  28.85 
 
 		 574 aa  50.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.391282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>