23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1931 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2033  hypothetical protein  59.62 
 
 		 620 aa  669    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461575  hitchhiker  0.0000553349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2430  response regulator receiver protein  58.89 
 
 		 619 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2314  response regulator receiver protein  58.89 
 
 		 619 aa  650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1931  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  100 
 
 		 583 aa  1185    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2031  response regulator receiver protein  59.11 
 
 		 620 aa  660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1891  hypothetical protein  54.26 
 
 		 635 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.724529 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2087  hypothetical protein  54.76 
 
 		 635 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1946  response regulator receiver protein  52.96 
 
 		 646 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2437  hypothetical protein  53.87 
 
 		 631 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2582  response regulator receiver protein  40.39 
 
 		 577 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0740866  hitchhiker  0.000257822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2373  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  39.9 
 
 		 580 aa  382  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2023  response regulator receiver protein  36.35 
 
 		 582 aa  355  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2086  hypothetical protein  34.94 
 
 		 591 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.869328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2191  hypothetical protein  34.96 
 
 		 600 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000298084  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1894  hypothetical protein  32.88 
 
 		 583 aa  257  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.910891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1850  hypothetical protein  31.12 
 
 		 554 aa  217  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.543722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  30.26 
 
 		 682 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  33.33 
 
 		 679 aa  47.4  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  24.61 
 
 		 683 aa  45.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0084  oligopeptidase A  23.04 
 
 		 731 aa  44.7  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.611624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0596  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.86 
 
 		 672 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2249  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.99 
 
 		 672 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0488613  normal  0.482949 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1708  oligopeptidase A  32.76 
 
 		 675 aa  43.9  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0475458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>