29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1693 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1693  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  273  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337002  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2497  hypothetical protein  84.68 
 
 		 124 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1825  hypothetical protein  84.68 
 
 		 124 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0194222  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1788  hypothetical protein  84.68 
 
 		 124 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1781  hypothetical protein  83.87 
 
 		 124 aa  210  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0111743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2872  hypothetical protein  87.1 
 
 		 124 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1645  hypothetical protein  76.23 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1753  hypothetical protein  72 
 
 		 125 aa  176  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819388  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1647  hypothetical protein  84.92 
 
 		 126 aa  173  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2421  hypothetical protein  84.92 
 
 		 126 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0112375  hitchhiker  0.000913176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2349  hypothetical protein  84.92 
 
 		 126 aa  170  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0136957  decreased coverage  0.000000000361738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2167  hypothetical protein  72.13 
 
 		 123 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1839  hypothetical protein  63.11 
 
 		 123 aa  165  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2439  hypothetical protein  68.03 
 
 		 123 aa  154  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1969  hypothetical protein  68.29 
 
 		 123 aa  150  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00366875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1915  hypothetical protein  61.29 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  55.29 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  37.21 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3192  hypothetical protein  35.96 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  35 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  52.17 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2486  hypothetical protein  52.17 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002785  hypothetical protein  41.32 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03196  hypothetical protein  41.96 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  35.62 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  33.33 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  26.79 
 
 		 125 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2778  hypothetical protein  32.74 
 
 		 115 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>