18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0536 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0536  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  254  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0213878  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4086  hypothetical protein  77.69 
 
 		 121 aa  199  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3283  hypothetical protein  70.25 
 
 		 121 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0514  hypothetical protein  72.27 
 
 		 135 aa  187  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3796  hypothetical protein  70.83 
 
 		 121 aa  186  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3852  hypothetical protein  70.83 
 
 		 121 aa  186  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0472  hypothetical protein  70.83 
 
 		 121 aa  186  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.088779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0513  hypothetical protein  72.27 
 
 		 121 aa  186  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.819192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3518  hypothetical protein  72.27 
 
 		 121 aa  186  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0513  hypothetical protein  72.27 
 
 		 121 aa  186  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3346  hypothetical protein  69.42 
 
 		 121 aa  186  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3978  hypothetical protein  70 
 
 		 121 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3361  hypothetical protein  71.19 
 
 		 127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3591  hypothetical protein  69.75 
 
 		 121 aa  180  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0551  hypothetical protein  70.83 
 
 		 121 aa  179  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3192  hypothetical protein  63.87 
 
 		 123 aa  173  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  25.21 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  26.61 
 
 		 285 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>