12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5913 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5913  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  498  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32960  hypothetical protein  71.6 
 
 
212 aa  249  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3431  hypothetical protein  37.72 
 
 
214 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.101777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0647  hypothetical protein  36.26 
 
 
210 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350047  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3808  hypothetical protein  36.26 
 
 
210 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0394361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0529  hypothetical protein  33.15 
 
 
218 aa  99.4  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1677  hypothetical protein  36.96 
 
 
286 aa  98.6  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940922  normal  0.239648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0441  hypothetical protein  31.33 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1682  hypothetical protein  36.26 
 
 
291 aa  95.5  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444652  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1352  hypothetical protein  28.86 
 
 
203 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1420  hypothetical protein  29.2 
 
 
228 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0665551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4377  hypothetical protein  24.24 
 
 
230 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0177111  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>