36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0508 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  100 
 
 
759 aa  1465    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  45.89 
 
 
820 aa  561  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  46.67 
 
 
820 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  37.7 
 
 
751 aa  364  3e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  37.87 
 
 
752 aa  350  4e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  38 
 
 
747 aa  345  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  37.94 
 
 
790 aa  327  6e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  35.97 
 
 
758 aa  324  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  36.92 
 
 
764 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  36.66 
 
 
764 aa  320  6e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  34.96 
 
 
837 aa  319  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  36.6 
 
 
739 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  37.12 
 
 
756 aa  311  4e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  36.04 
 
 
751 aa  301  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  37.55 
 
 
761 aa  300  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  34.75 
 
 
748 aa  294  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  34.97 
 
 
789 aa  288  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  33.54 
 
 
789 aa  277  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  33.54 
 
 
857 aa  253  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  34.78 
 
 
876 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  34.15 
 
 
726 aa  248  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  32.07 
 
 
777 aa  244  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  32.52 
 
 
758 aa  240  8e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  29.27 
 
 
834 aa  231  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  28.81 
 
 
826 aa  223  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  33.51 
 
 
762 aa  211  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  36.59 
 
 
817 aa  203  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  35.45 
 
 
953 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  32.36 
 
 
779 aa  182  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  29.4 
 
 
822 aa  177  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  36.06 
 
 
745 aa  169  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  28.69 
 
 
840 aa  167  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  31.77 
 
 
798 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  28.68 
 
 
719 aa  140  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  32.05 
 
 
856 aa  139  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0638496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5357  hypothetical protein  30.51 
 
 
449 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>