17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6117 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6117    100 
 
 		 105 bp  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.692526 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0961  transposase A  92.11 
 
 		 306 bp  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.092394  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3885  transposase A  92.11 
 
 		 291 bp  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3882  transposase A  92.11 
 
 		 291 bp  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3813  transposase A  92.11 
 
 		 291 bp  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.633568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2708  transposase A  92.11 
 
 		 291 bp  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406372  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1550  transposase A  92.11 
 
 		 291 bp  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0091  transposase A  92.11 
 
 		 291 bp  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.582456  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0157  transposase A  92.11 
 
 		 264 bp  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.913666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1725  transposase A  92.11 
 
 		 306 bp  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0785  transposase A  92.11 
 
 		 306 bp  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1163  transposase IS3/IS911  90.24 
 
 		 279 bp  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966557  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2592    93.55 
 
 		 257 bp  46.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.743625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3322  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 3582 bp  44.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1548  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 267 bp  44.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 3579 bp  44.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215973  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3466  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 3576 bp  44.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>