15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1911 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1911  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1849  methyltransferase small  57.43 
 
 		 235 aa  222  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.105583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0521  hypothetical protein  53.85 
 
 		 205 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6273  hypothetical protein  47.69 
 
 		 226 aa  177  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6985  hypothetical protein  46.76 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4247  hypothetical protein  46.38 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4092  hypothetical protein  45.89 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2625  hypothetical protein  45.5 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0657  hypothetical protein  41.96 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3567  hypothetical protein  48.18 
 
 		 136 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2441  hypothetical protein  34.53 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5719  hypothetical protein  28.65 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0059  hypothetical protein  28.11 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.459485  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0325  hypothetical protein  27.47 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000884213  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1069  putative DNA methyltransferase  28 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>