20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2938 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2938  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0781616  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1958  hypothetical protein  52.22 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.781957  normal  0.865529 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0137  hypothetical protein  39.17 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0856  hypothetical protein  41.76 
 
 		 97 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2546  hypothetical protein  35 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.211724  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1819  hypothetical protein  48.75 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0698228  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2318  hypothetical protein  43.02 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2221  hypothetical protein  42.39 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3321  hypothetical protein  41.11 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2552  hypothetical protein  39.77 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003649  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1930  hypothetical protein  42.5 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4743  hypothetical protein  47.14 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369246  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4057  hypothetical protein  43.84 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04095  hypothetical protein  47.06 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0954  hypothetical protein  43.28 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1114  hypothetical protein  43.28 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0768  protein of unknown function UPF0153  35.23 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1877  hypothetical protein  36.26 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4386  protein of unknown function UPF0153  34.02 
 
 		 228 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  0.783994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>