35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2615 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2615  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  155  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616252  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01225  hypothetical protein  68.35 
 
 
78 aa  100  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0533489  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1243  hypothetical protein  65.22 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.315474  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1275  hypothetical protein  65.22 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002290  protein SlyX  36.11 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000547395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00064  hypothetical protein  36.11 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1638  hypothetical protein  37.5 
 
 
73 aa  51.2  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2763  hypothetical protein  37.14 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000693224  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3765  hypothetical protein  34.72 
 
 
72 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104944  hitchhiker  0.00334297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03199  hypothetical protein  43.48 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000178698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03150  hypothetical protein  43.48 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000206998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4657  hypothetical protein  43.48 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000460894  normal  0.0210084 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0365  SlyX family protein  43.48 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000201825  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3722  hypothetical protein  43.48 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667442  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3629  hypothetical protein  43.48 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000249796  hitchhiker  0.000764322 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0365  hypothetical protein  43.48 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0292296  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3544  hypothetical protein  43.48 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000241633  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3822  hypothetical protein  42.03 
 
 
72 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0171365  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3651  hypothetical protein  42.03 
 
 
72 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196147  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3650  hypothetical protein  42.03 
 
 
72 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000204325  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3817  hypothetical protein  42.03 
 
 
72 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000379865  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3724  hypothetical protein  42.03 
 
 
72 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00636343  normal  0.193548 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3759  hypothetical protein  42.03 
 
 
72 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0169067  normal  0.244895 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3927  hypothetical protein  38.24 
 
 
72 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0208778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3684  hypothetical protein  38.24 
 
 
72 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.260505  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0269  hypothetical protein  38.24 
 
 
72 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0303  hypothetical protein  32.86 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1356  SlyX protein  31.43 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691265  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0307  SlyX family protein  39.71 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1200  hypothetical protein  37.84 
 
 
71 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2555  SlyX family protein  36.23 
 
 
72 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106736  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0110  SlyX  35.53 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0826  SlyX family protein  35.29 
 
 
70 aa  40.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0859393  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2982  SlyX family protein  38.24 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.781182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3842  hypothetical protein  39.44 
 
 
72 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>