18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1838 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1838  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  270  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0778721  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0256  hypothetical protein  75 
 
 		 132 aa  206  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0226  hypothetical protein  75 
 
 		 132 aa  206  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1364  hypothetical protein  57.14 
 
 		 134 aa  155  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00062  PIN domain, putative  45.11 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0134903  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3256  nucleic acid-binding protein  24.53 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1457  PilT protein domain protein  26.92 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.767558  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2739  PilT protein domain protein  32.84 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2562  PilT domain-containing protein  29.77 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2684  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285595  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2595  PilT domain-containing protein  28.03 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.129291 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3221  hypothetical protein  26.87 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0447  PilT protein-like  25.56 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.289411 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3167  PilT domain-containing protein  27.69 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000731556  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2132  PilT protein-like  25.56 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0313622  normal  0.0299917 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2924  nucleic acid-binding protein  24.18 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3514  PilT protein domain protein  28.78 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.522496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1920  PilT protein  27.07 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>