13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1182 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1182  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  713    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.331396  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0136  hypothetical protein  52.72 
 
 		 357 aa  307  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4332  hypothetical protein  51.32 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158743 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5530  hypothetical protein  27.96 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1036  hypothetical protein  32.92 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.801484 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1027  hypothetical protein  23.27 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  27.27 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  21.02 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4655  hypothetical protein  22.97 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  23.84 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1930  protein of unknown function DUF482  28.02 
 
 		 374 aa  43.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.207995 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  26.28 
 
 		 406 aa  42.7  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  24.86 
 
 		 405 aa  42.7  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0856188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>