16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1164 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1164  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  358  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2373  hypothetical protein  56.13 
 
 		 217 aa  144  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2324  Calcium-binding EF-hand-containing protein  52.45 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2835  hypothetical protein  51.96 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105158  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2471  hypothetical protein  30 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08671  hypothetical protein  33.16 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1429  hypothetical protein  37.41 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2629  hypothetical protein  34.62 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1658  hypothetical protein  34.5 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.105631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0116  Protein of unknown function DUF2302  32.24 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3952  hypothetical protein  33.78 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.202628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0660  hypothetical protein  36.17 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.460127  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  27.04 
 
 		 417 aa  44.7  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  28.17 
 
 		 416 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1832  hypothetical protein  29.65 
 
 		 285 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0910711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0109  Protein of unknown function DUF2302  30.17 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>