22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6614 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6614  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein PqaA type  100 
 
 		 457 aa  948    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3217  hypothetical protein  62.62 
 
 		 454 aa  579  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1356  hypothetical protein  39.19 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1797  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  34.62 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0548814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1834  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  34.34 
 
 		 423 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1682  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  35.43 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.636927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01585  PhoPQ-regulated protein  28.06 
 
 		 501 aa  139  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0207412  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1656  PqaA protein  22.92 
 
 		 496 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1648  PqaA protein  22.92 
 
 		 496 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439725  normal  0.998647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1626  PqaA protein  22.92 
 
 		 496 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1715  PqaA protein  22.69 
 
 		 496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0113  PqaA  27.53 
 
 		 495 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1792  PqaA protein  23.15 
 
 		 496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4917  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  25.06 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5043  hypothetical protein  24.81 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0123  PqaA protein  26.21 
 
 		 483 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434037  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1596  hypothetical protein  26.21 
 
 		 495 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05517  putative transmembrane protein  24.27 
 
 		 517 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0147  PqaA protein  26.21 
 
 		 483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3028  hypothetical protein  22.73 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.346264 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2842  hypothetical protein  19.75 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2286  hypothetical protein  19.49 
 
 		 494 aa  59.7  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>