65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2358 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2358  protein of unknown function DUF336  100 
 
 
172 aa  353  5.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.61424  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1747  hypothetical protein  60.84 
 
 
163 aa  205  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29320  hypothetical protein  57.43 
 
 
166 aa  177  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1996  hypothetical protein  53.55 
 
 
161 aa  175  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1660  hypothetical protein  51.88 
 
 
165 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0922603  normal  0.0534906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0452  hypothetical protein  51.88 
 
 
172 aa  170  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1674  hypothetical protein  51.25 
 
 
165 aa  167  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2872  hypothetical protein  50.62 
 
 
164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1814  hypothetical protein  50.62 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2914  hypothetical protein  49.08 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963659  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2653  hypothetical protein  49.38 
 
 
165 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.86632  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1246  hypothetical protein  50 
 
 
165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0773  hypothetical protein  50 
 
 
165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290563  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0389  hypothetical protein  50 
 
 
165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1983  hypothetical protein  50 
 
 
189 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1831  hypothetical protein  50 
 
 
189 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1731  hypothetical protein  50 
 
 
189 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2506  hypothetical protein  48.75 
 
 
165 aa  159  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2503  hypothetical protein  46.88 
 
 
165 aa  158  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1480  hypothetical protein  48.12 
 
 
165 aa  157  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166685  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1734  hypothetical protein  47.5 
 
 
165 aa  157  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216168  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1078  hypothetical protein  48.12 
 
 
165 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1534  hypothetical protein  48.12 
 
 
165 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1558  hypothetical protein  48.12 
 
 
165 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1459  hypothetical protein  47.5 
 
 
165 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4700  hypothetical protein  47.5 
 
 
165 aa  154  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.786571  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1764  hypothetical protein  54.37 
 
 
160 aa  151  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1581  hypothetical protein  46.1 
 
 
171 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003593  hypothetical protein  49.66 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1914  protein of unknown function DUF336  42.41 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.180095 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1792  hypothetical protein  45.39 
 
 
171 aa  139  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2342  hypothetical protein  48.61 
 
 
161 aa  136  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1243  hypothetical protein  43.8 
 
 
159 aa  125  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0924995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5390  hypothetical protein  45.14 
 
 
168 aa  120  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1766  hypothetical protein  38.36 
 
 
169 aa  120  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.267084  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1367  hypothetical protein  42.76 
 
 
169 aa  110  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3449  hypothetical protein  38.03 
 
 
158 aa  110  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1411  hypothetical protein  42.76 
 
 
169 aa  110  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.851451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3196  hypothetical protein  38.03 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3175  hypothetical protein  38.03 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000510798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3426  hypothetical protein  38.03 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3104  hypothetical protein  37.32 
 
 
216 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4513  hypothetical protein  35 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2291  protein of unknown function DUF336  40.88 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3413  hypothetical protein  37.32 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3413  hypothetical protein  37.59 
 
 
206 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05610  hypothetical protein  36.62 
 
 
155 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.237845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3106  hypothetical protein  35.86 
 
 
158 aa  104  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3401  hypothetical protein  36.88 
 
 
158 aa  104  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1842  hypothetical protein  36.11 
 
 
158 aa  103  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.935839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4062  hypothetical protein  41.18 
 
 
155 aa  97.1  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.628231  normal  0.565272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0245  protein of unknown function DUF336  38.36 
 
 
155 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0133  protein of unknown function DUF336  42.19 
 
 
159 aa  87.4  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66044  predicted protein  33.56 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.148486  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1852  hypothetical protein  34.06 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1397  hypothetical protein  37.98 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.851845 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1419  hypothetical protein  38.76 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0937  hypothetical protein  38.76 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415514  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1896  hypothetical protein  35.66 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12350  hypothetical protein  36.99 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4563  hypothetical protein  35.94 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172322  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1338  hypothetical protein  37.88 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1299  hypothetical protein  36.03 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2865  protein of unknown function DUF336  30 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0168022 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02061  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04590)  32.76 
 
 
439 aa  63.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>