14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1964 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1964  Putative helicase A859L  100 
 
 		 403 aa  813    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112018  normal  0.0337679 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4501  hypothetical protein  55.19 
 
 		 409 aa  431  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0854244  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3313  conserved hypothetical cytosolic protein  53.38 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1284  YeeC-like protein  53.06 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3048  YeeC-like protein  53.52 
 
 		 392 aa  413  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1752  YeeC-like protein  52.16 
 
 		 391 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.870079  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5331  putative cytoplasmic protein  52.32 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15600  hypothetical protein  50 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000896111  unclonable  6.48725e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2528  hypothetical protein  50.51 
 
 		 403 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.122585  hitchhiker  0.000213496 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0265  hypothetical protein  47.17 
 
 		 391 aa  344  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.77928  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0761  hypothetical protein  34.13 
 
 		 398 aa  181  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0739979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1467  hypothetical protein  31.57 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3041  hypothetical protein  30 
 
 		 419 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0030  hypothetical protein  30.54 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>