17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0475 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0475  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.33606  normal  0.699739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2899  hypothetical protein  64.92 
 
 
199 aa  270  9e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1555  hypothetical protein  61.38 
 
 
190 aa  245  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.247042  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0933  hypothetical protein  59.89 
 
 
191 aa  224  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02070  hypothetical protein  54.3 
 
 
190 aa  221  7e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273031  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0523  hypothetical protein  53.76 
 
 
189 aa  213  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2172  hypothetical protein  55.25 
 
 
190 aa  212  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4023  hypothetical protein  52.6 
 
 
192 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0649  hypothetical protein  44.74 
 
 
194 aa  186  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2653  hypothetical protein  35.11 
 
 
197 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1548  hypothetical protein  34.74 
 
 
190 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0780  hypothetical protein  34.2 
 
 
193 aa  125  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247882  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1441  hypothetical protein  36.11 
 
 
183 aa  125  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46496  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1177  hypothetical protein  38.89 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.518058 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0928  hypothetical protein  36.46 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1206  hypothetical protein  34.72 
 
 
192 aa  118  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1115  hypothetical protein  33.51 
 
 
190 aa  115  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>