35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31420 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  100 
 
 		 953 aa  1780    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  50.21 
 
 		 817 aa  483  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  50.25 
 
 		 745 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  48.82 
 
 		 762 aa  372  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  33.83 
 
 		 822 aa  314  5.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  48.46 
 
 		 789 aa  308  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  43.88 
 
 		 857 aa  305  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  41.34 
 
 		 837 aa  298  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  40.14 
 
 		 751 aa  290  8e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  44.94 
 
 		 790 aa  287  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  36.49 
 
 		 761 aa  279  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  41.3 
 
 		 752 aa  271  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  41.56 
 
 		 789 aa  265  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  43.33 
 
 		 747 aa  264  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  34.95 
 
 		 820 aa  262  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  34.23 
 
 		 834 aa  251  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  35.66 
 
 		 777 aa  247  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  38.52 
 
 		 876 aa  241  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  34.94 
 
 		 826 aa  238  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  39.7 
 
 		 764 aa  237  8e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  39.89 
 
 		 764 aa  237  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  39.89 
 
 		 739 aa  237  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  37.57 
 
 		 751 aa  232  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  38.25 
 
 		 756 aa  231  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  39.4 
 
 		 758 aa  231  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  36.07 
 
 		 748 aa  230  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  39.36 
 
 		 820 aa  228  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  41.79 
 
 		 758 aa  213  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  34.9 
 
 		 759 aa  207  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  36.05 
 
 		 779 aa  206  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  38.19 
 
 		 719 aa  191  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  36.67 
 
 		 726 aa  189  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  35.2 
 
 		 798 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  34.93 
 
 		 840 aa  173  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  32.79 
 
 		 856 aa  135  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0638496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>