29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18200 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18200  Protein of unknown function (DUF2581)  100 
 
 		 151 aa  296  7e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1732  hypothetical protein  44.53 
 
 		 153 aa  98.2  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0454052  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1864  Protein of unknown function DUF2581  46.43 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0408425  normal  0.232813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2055  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2974  hypothetical protein  42.75 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12800  Protein of unknown function (DUF2581)  41.43 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0224301  decreased coverage  0.00565206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1376  hypothetical protein  36.69 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.486937 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16060  Protein of unknown function (DUF2581)  35.04 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.199919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2992  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.10835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2837  hypothetical protein  32.86 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36145  normal  0.0579285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3113  hypothetical protein  35.25 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0863  Protein of unknown function DUF2581  34.75 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17667  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1082  hypothetical protein  30.65 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2559  Protein of unknown function DUF2581  32.12 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.260475  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2696  hypothetical protein  30.53 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3717  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.668266  normal  0.103585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5216  hypothetical protein  35.48 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11446  hypothetical protein  34.15 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0232943  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1881  hypothetical protein  34.43 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0884848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4149  hypothetical protein  33.98 
 
 		 214 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.638861  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2453  hypothetical protein  36.61 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1874  hypothetical protein  34.33 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15750  Protein of unknown function (DUF2581)  32.67 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2433  hypothetical protein  31.68 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.504419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2439  hypothetical protein  31.68 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2392  hypothetical protein  31.68 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142934  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1308  hypothetical protein  25.64 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.142143  normal  0.197231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3051  hypothetical protein  40.3 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2357  Protein of unknown function DUF2581  39.71 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>