30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13820 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13820  uncharacterized conserved protein with thioredoxin-like domain  100 
 
 		 323 aa  640    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5270  Sucraseferredoxin family protein  40.33 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2240  sucraseferredoxin family protein  40.97 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6685  hypothetical protein  38.67 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1795  Sucraseferredoxin family protein  41.03 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0338  sucraseferredoxin family protein  34.8 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1766  Sucraseferredoxin family protein  36.82 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4380  sucraseferredoxin family protein  36.95 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4377  sucraseferredoxin family protein  34.93 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0587956  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8095  Sucraseferredoxin family protein  41.47 
 
 		 234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2908  Sucraseferredoxin family protein  35.29 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5340  sucraseferredoxin family protein  32.93 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.901473  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5631  sucraseferredoxin family protein  32.93 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5251  sucraseferredoxin-like protein  32.93 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02490  uncharacterized conserved protein with thioredoxin-like domain  38.43 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3280  Sucraseferredoxin family protein  39.29 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3065  Sucraseferredoxin family protein  37.05 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000185478  hitchhiker  0.00205688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1340  Sucraseferredoxin family protein  36.29 
 
 		 268 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421578  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0955  Sucraseferredoxin family protein  39.27 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.886609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3033  sucraseferredoxin-like  26.18 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.262955  hitchhiker  0.00219158 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1568  sucraseferredoxin family protein  28.02 
 
 		 327 aa  86.3  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4340  hypothetical protein  27.16 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5760  Sucraseferredoxin family protein  23.98 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1040  sucraseferredoxin-like protein  28.39 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4480  sucraseferredoxin family protein  23.43 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2831  hypothetical protein  22.51 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4698  sucraseferredoxin family protein  30.38 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05570  conserved hypothetical protein  32.8 
 
 		 445 aa  55.8  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2755  sucraseferredoxin-like  35.05 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57097  predicted protein  24.49 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0827134  normal  0.0493336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>