19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13050 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13050  VTC domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  518  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1904  hypothetical protein  44.66 
 
 		 265 aa  194  9e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1573  VTC domain protein  48.29 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.375137  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0852  hypothetical protein  49.59 
 
 		 277 aa  169  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.538253  normal  0.0167402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3221  hypothetical protein  49 
 
 		 281 aa  168  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3226  hypothetical protein  47.6 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4795  VTC domain protein  42 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3209  hypothetical protein  44.98 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.435311  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3117  hypothetical protein  43.95 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0313259  normal  0.140705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 735 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1332  hypothetical protein  40.23 
 
 		 251 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03050  VTC domain-containing protein  43.03 
 
 		 283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1490  hypothetical protein  35.55 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00472854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2551  hypothetical protein  34.43 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2816  hypothetical protein  30.62 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.850496  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3873  hypothetical protein  29.32 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0807  hypothetical protein  34.25 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07681  hypothetical protein  24.06 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0997365  hitchhiker  0.000779865 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2978  hypothetical protein  25.4 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>