59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0274 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0274  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  258  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3671  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  258  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3875  hypothetical protein  97.73 
 
 
132 aa  253  6e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0588899 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0309  hypothetical protein  93.18 
 
 
132 aa  248  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4091  hypothetical protein  87.88 
 
 
136 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4178  hypothetical protein  87.88 
 
 
136 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4060  hypothetical protein  87.12 
 
 
136 aa  227  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3982  hypothetical protein  86.36 
 
 
136 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3683  hypothetical protein  83.33 
 
 
136 aa  221  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0278  hypothetical protein  67.19 
 
 
136 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3440  hypothetical protein  61.72 
 
 
131 aa  164  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140437  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0381  hypothetical protein  57.25 
 
 
133 aa  155  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0232  hypothetical protein  64.06 
 
 
131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.558206  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4219  hypothetical protein  55.3 
 
 
133 aa  150  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0395  hypothetical protein  62.5 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3350  hypothetical protein  53.91 
 
 
134 aa  123  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3680  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  41.23 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0339  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  40.48 
 
 
130 aa  83.6  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01106  uncharacterized relative of glutathione S-transferase  38.46 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.285052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2892  uncharacterized relative of glutathione S-transferase  38.21 
 
 
129 aa  77  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000277  glutathione S-transferase-related protein  34.4 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.829142  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2150  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.195543  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2428  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  72  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940276  normal  0.0458059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2037  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2437  putative inner membrane protein  34.11 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2100  putative inner membrane protein  32.56 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1317  putative inner membrane protein  32.56 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2605  putative inner membrane protein  32.56 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.906436  normal  0.129017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0704  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  41.46 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01828  hypothetical protein  32.56 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1771  conserved hypothetical protein  32.56 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000931385  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1963  putative inner membrane protein  32.56 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823774  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1421  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  39.81 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573394  normal  0.982205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01840  predicted inner membrane protein  32.56 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1763  hypothetical protein  32.56 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2118  hypothetical protein  32.56 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172403 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1343  putative inner membrane protein  32.56 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.46281  hitchhiker  0.000563123 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1219  putative inner membrane protein  32.56 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2058  hypothetical protein  32.56 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.85974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2063  hypothetical protein  32.56 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2096  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2264  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0640  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  37.61 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.136353 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2167  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1812  hypothetical protein  39.58 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2045  glutathione S-transfersae-related protein  30.89 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3553  hypothetical protein  36.8 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.575226  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0111  hypothetical protein  37.78 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2369  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  35.92 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5320  uncharacterized relative of glutathione S-transferase MAPEG superfamily-like protein  36.26 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27569  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5245  hypothetical protein  36.26 
 
 
132 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  0.633428 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0632  hypothetical protein  35.4 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4778  hypothetical protein  35.16 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155275  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2785  hypothetical protein  30.36 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639584  normal  0.118988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4532  hypothetical protein  32.97 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2172  hypothetical protein  36.26 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.842297 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1964  hypothetical protein  28.21 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1970  hypothetical protein  28.21 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1919  hypothetical protein  36.14 
 
 
132 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.082905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>