17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2878 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2878  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  343  7e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00543287  hitchhiker  0.000193701 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2960  hypothetical protein  98.77 
 
 		 163 aa  339  9e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.373099  hitchhiker  0.00896796 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3056  hypothetical protein  96.93 
 
 		 163 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469706  normal  0.0518674 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3141  hypothetical protein  92.02 
 
 		 163 aa  320  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1249  hypothetical protein  92.02 
 
 		 163 aa  320  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1172  hypothetical protein  91.41 
 
 		 163 aa  320  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0188843  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1318  hypothetical protein  92.02 
 
 		 163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1216  hypothetical protein  91.41 
 
 		 163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.445968  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1130  hypothetical protein  87.58 
 
 		 153 aa  285  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.165556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0851  hypothetical protein  72.39 
 
 		 157 aa  254  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.403973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1213  hypothetical protein  68.71 
 
 		 158 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1111  hypothetical protein  68.71 
 
 		 159 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1023  hypothetical protein  67.53 
 
 		 159 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2805  hypothetical protein  66.87 
 
 		 157 aa  229  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0997  hypothetical protein  66.24 
 
 		 159 aa  227  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2970  hypothetical protein  63.19 
 
 		 158 aa  219  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466871  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  27.13 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>