59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3875 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3875  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  259  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0588899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0274  hypothetical protein  97.73 
 
 
132 aa  253  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3671  hypothetical protein  97.73 
 
 
132 aa  253  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0309  hypothetical protein  92.42 
 
 
132 aa  245  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4178  hypothetical protein  87.12 
 
 
136 aa  225  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4091  hypothetical protein  87.12 
 
 
136 aa  225  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4060  hypothetical protein  86.36 
 
 
136 aa  224  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3982  hypothetical protein  85.61 
 
 
136 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3683  hypothetical protein  81.06 
 
 
136 aa  215  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0278  hypothetical protein  67.19 
 
 
136 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3440  hypothetical protein  62.5 
 
 
131 aa  165  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140437  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0381  hypothetical protein  57.25 
 
 
133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0232  hypothetical protein  64.84 
 
 
131 aa  153  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.558206  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4219  hypothetical protein  56.06 
 
 
133 aa  151  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0395  hypothetical protein  62.5 
 
 
131 aa  144  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3350  hypothetical protein  53.12 
 
 
134 aa  121  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3680  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  42.11 
 
 
133 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0339  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  39.68 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01106  uncharacterized relative of glutathione S-transferase  38.46 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.285052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2892  uncharacterized relative of glutathione S-transferase  38.21 
 
 
129 aa  77  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000277  glutathione S-transferase-related protein  33.6 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.829142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2428  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940276  normal  0.0458059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2150  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.195543  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2037  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1317  putative inner membrane protein  33.33 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2605  putative inner membrane protein  33.33 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.906436  normal  0.129017 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01828  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2100  putative inner membrane protein  33.33 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01840  predicted inner membrane protein  33.33 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1771  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000931385  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1963  putative inner membrane protein  33.33 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1763  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0704  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  41.46 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2118  hypothetical protein  32.56 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172403 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2264  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1343  putative inner membrane protein  32.56 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.46281  hitchhiker  0.000563123 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1219  putative inner membrane protein  32.56 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2058  hypothetical protein  32.56 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.85974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2063  hypothetical protein  32.56 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2437  putative inner membrane protein  33.33 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1421  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  38.89 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573394  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2096  hypothetical protein  40.62 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0640  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  37.61 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.136353 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2167  hypothetical protein  32.56 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2045  glutathione S-transfersae-related protein  30.89 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1812  hypothetical protein  38.54 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3553  hypothetical protein  36.8 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.575226  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5320  uncharacterized relative of glutathione S-transferase MAPEG superfamily-like protein  36.26 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27569  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2369  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  34.95 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5245  hypothetical protein  36.67 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  0.633428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4778  hypothetical protein  35.56 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155275  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0111  hypothetical protein  34.38 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0632  hypothetical protein  35.4 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2785  hypothetical protein  30.36 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639584  normal  0.118988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2172  hypothetical protein  37.36 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.842297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4532  hypothetical protein  34.07 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1919  hypothetical protein  32.2 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.082905  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1964  hypothetical protein  27.35 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1970  hypothetical protein  27.35 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>