11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3857 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3857  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  973    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220311 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0103  hypothetical protein  31.24 
 
 		 461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887161  hitchhiker  0.0000190274 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  40.4 
 
 		 1105 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3763  hypothetical protein  26.41 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.493237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2162  hypothetical protein  28.46 
 
 		 439 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5757  hypothetical protein  25.56 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0433  hypothetical protein  22.07 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2281  hypothetical protein  23.57 
 
 		 313 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.510695  hitchhiker  0.0000660133 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4366  hypothetical protein  27.4 
 
 		 321 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1574  hypothetical protein  27.5 
 
 		 332 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.832437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3154  hypothetical protein  25.29 
 
 		 323 aa  43.5  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0129126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>